More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3029 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  100 
 
 		 484 aa  1002    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 		 476 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  36.83 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 		 476 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  36.3 
 
 		 477 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 		 476 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 476 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  35.31 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  29.16 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 450 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  28.27 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 476 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 460 aa  207  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  30.07 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  34.9 
 
 		 465 aa  200  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  33.25 
 
 		 462 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  30.02 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 489 aa  196  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 458 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 489 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 447 aa  156  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  26 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 403 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 351 aa  110  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 481 aa  99.8  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 400 aa  99.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 728 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  28.54 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.45 
 
 		 391 aa  95.1  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.45 
 
 		 391 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 391 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 434 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  28.16 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 290 aa  90.9  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  31.91 
 
 		 481 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 385 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  25.23 
 
 		 385 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 385 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 385 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 385 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  25.23 
 
 		 385 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.38 
 
 		 394 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  26.17 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 385 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 405 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 434 aa  86.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.38 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.38 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  27.03 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.66 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  27.48 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  24.23 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  23.11 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  26.7 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  28.57 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>