More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0871 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 489 aa  1014    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  57.48 
 
 		 450 aa  558  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  55.34 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  50.85 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  49.89 
 
 		 461 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  50.75 
 
 		 450 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  49.78 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  50.97 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  48.19 
 
 		 457 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  49.02 
 
 		 450 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  45.55 
 
 		 476 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  42.8 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  44.06 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  41.49 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  40.16 
 
 		 489 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  26.89 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 463 aa  190  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  29.01 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  29.15 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.43 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 485 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 476 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 476 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 728 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.65 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 486 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 394 aa  103  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 290 aa  99.8  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 459 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  28.36 
 
 		 438 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  26.77 
 
 		 275 aa  90.5  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 446 aa  90.5  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 450 aa  90.1  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 445 aa  90.1  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  24.61 
 
 		 481 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 507 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 365 aa  89  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  22.72 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 443 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 356 aa  87  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.6 
 
 		 457 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 565 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  21.86 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25.37 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 356 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.09 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>