More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1280 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 346 aa  699    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  52.94 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  45.37 
 
 		 344 aa  238  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 457 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.82 
 
 		 457 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  27.17 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  27.51 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.52 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.52 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.05 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.28 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.86 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.28 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.37 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.73 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  25.56 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 565 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 510 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  34.06 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  26.33 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  24.4 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.04 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  33.95 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  38.06 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  24.27 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.47 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25.75 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  26.17 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  24.43 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  24.43 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.52 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.33 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  24.59 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  30.5 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  33.75 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>