More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1445 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 468 aa  983    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  43.04 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  41.95 
 
 		 483 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  26.39 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 454 aa  126  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  28.13 
 
 		 434 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 442 aa  106  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 434 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  25.67 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 339 aa  99  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  28.53 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.15 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 452 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  28.72 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 311 aa  87  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.78 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.78 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  23.34 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  24.94 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  24.94 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.03 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 281 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  21.48 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  39.34 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  22.85 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  23.33 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  20.92 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  21.98 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.67 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.43 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.29 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>