161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1520 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  99.04 
 
 		 442 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  641    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 400 aa  94  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.76 
 
 		 483 aa  92.8  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 		 454 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 		 454 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 459 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 468 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  22.58 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 436 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  22.5 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.51 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 510 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 489 aa  72.8  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 443 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 439 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 489 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.75 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  20.58 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.51 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  22.11 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.34 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  23.21 
 
 		 473 aa  62.4  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.34 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 452 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.46 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.46 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  21.84 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 462 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  21.58 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  34.26 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 450 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  20.07 
 
 		 454 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  22.8 
 
 		 445 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 460 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 453 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  21.2 
 
 		 380 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  34.02 
 
 		 468 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 462 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 565 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  22.15 
 
 		 383 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  22.19 
 
 		 411 aa  52.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.37 
 
 		 484 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  22.07 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  21.16 
 
 		 485 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  22.07 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  21.74 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 		 411 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  22.06 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 		 476 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  21.84 
 
 		 435 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 476 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  21.75 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 476 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  21.75 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>