264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1058 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
455 aa  946    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 
449 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 
486 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 
450 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 
442 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 
447 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 
442 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 
449 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
447 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.95 
 
 
483 aa  150  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 
477 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 
339 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 
434 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 
454 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 
454 aa  143  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  23.92 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.67 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 
468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 
443 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
434 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  25.81 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.13 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 
510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 
429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  24.37 
 
 
448 aa  113  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 
400 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 
484 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 
459 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 
394 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 
444 aa  107  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 
368 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 
436 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 
454 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 
440 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.66 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 
298 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 
419 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 
489 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 
455 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.94 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.38 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  22.43 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 
460 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  24 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 
461 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  23 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 
460 aa  73.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 
458 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0797  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0675001  decreased coverage  0.00122628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.54 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  21.62 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 
439 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  23.59 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  25.42 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  22.89 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  25.42 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  25.42 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.58 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
464 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 
453 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 
489 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  29 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  24 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 
457 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 
453 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  26.05 
 
 
411 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 
411 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  24.65 
 
 
438 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 
435 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
381 aa  61.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  21.76 
 
 
507 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  24.93 
 
 
411 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 
800 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
435 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  24.25 
 
 
374 aa  60.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>