More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1480 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  99.04 
 
 		 311 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 442 aa  908    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 415 aa  333  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 447 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 468 aa  106  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.55 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  22.81 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.15 
 
 		 432 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 510 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 447 aa  93.2  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  22.08 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  21.25 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 440 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.1 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  23.14 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  23.17 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.56 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  21.97 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  23.53 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  22.85 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  22.85 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  22.5 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  21.59 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  21.39 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  21.39 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  20.59 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  21.59 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  21.15 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  21.35 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.48 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  21.03 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  21.57 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  22.93 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  22.32 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>