More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4676 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 434 aa  906    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  52.98 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  34.85 
 
 		 329 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  31.59 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  27.88 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 454 aa  123  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 454 aa  123  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.81 
 
 		 483 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  26.87 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  28.13 
 
 		 468 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.55 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  33.65 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 454 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.92 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  25.63 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  27.71 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 728 aa  73.2  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  22.75 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.54 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  26.27 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  21.66 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  30.17 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.28 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  27.32 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  21.03 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  30.94 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  30.57 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  21.68 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>