178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0897 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 454 aa  952    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  47.1 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 449 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  24.16 
 
 		 448 aa  106  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 449 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 400 aa  93.6  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 339 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 445 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  23.52 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.7 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  29.15 
 
 		 339 aa  88.2  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 436 aa  87  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  25.94 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.58 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  22.66 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  21.2 
 
 		 455 aa  67  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.44 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.44 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  20.59 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  23.08 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  21.52 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 794 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 		 450 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  20.07 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  29.93 
 
 		 470 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 		 499 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  22.32 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  22.19 
 
 		 433 aa  54.3  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  22.74 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  22.74 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 464 aa  53.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  23.58 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  22.73 
 
 		 723 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  21.41 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  22.41 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  22.47 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 728 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0797  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 234 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0675001  decreased coverage  0.00122628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 781 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  26.71 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>