275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0142 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  66.39 
 
 		 483 aa  686    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 477 aa  1003    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  43.04 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  31.84 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 486 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  29.98 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  29.98 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 455 aa  146  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  26.06 
 
 		 448 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.11 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.01 
 
 		 432 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 429 aa  94  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 339 aa  93.6  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  24.8 
 
 		 452 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 436 aa  87  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.17 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  23.87 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.11 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  21.16 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 439 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  22.34 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  21.84 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.06 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  21.01 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.06 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.15 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.25 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.98 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  21.24 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.61 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  24.07 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  21.79 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.16 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  29.73 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  23.65 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  21.93 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  21.14 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.67 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>