229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0076 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 444 aa  922    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  32.95 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 442 aa  123  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 442 aa  123  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 486 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 449 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.45 
 
 		 432 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.14 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  27.62 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 429 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  22.87 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 281 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.1 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  31.1 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  28.15 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.03 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  34.87 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  22.68 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.03 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  20.81 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  26.12 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.39 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  21.41 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  31.29 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  27.78 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  27.78 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.52 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.09 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.52 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.52 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.52 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.06 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  21.24 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.52 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>