299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6334 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 419 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  31.31 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 449 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 510 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  28.29 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 339 aa  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  28.4 
 
 		 483 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 455 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  23.45 
 
 		 339 aa  86.7  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  26.55 
 
 		 452 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  27.83 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  22.43 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  27.15 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  22.03 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  22.03 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.46 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  33.33 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  31.79 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  25.1 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  26.5 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  20.56 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  33.1 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  25.65 
 
 		 326 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 394 aa  57  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  30.37 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0797  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0675001  decreased coverage  0.00122628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  29.8 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  28.82 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  21.41 
 
 		 391 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.9 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  21.41 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  21.41 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 485 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  30 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2102  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 548 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  31.75 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 476 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 499 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>