More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1624 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 486 aa  1010    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 447 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 449 aa  186  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  29.41 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 468 aa  173  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  29.1 
 
 		 448 aa  169  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  24.89 
 
 		 452 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 400 aa  137  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  29.14 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 339 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  29.32 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 442 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.6 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  30.65 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 298 aa  94.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 452 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  22.72 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  20.21 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  33.73 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.93 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  22.07 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.14 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.14 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.55 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  21.24 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  21.96 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  21.96 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 368 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  22.22 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  32.9 
 
 		 453 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.32 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  22.32 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  21.65 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.44 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  21.35 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  24.79 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25.42 
 
 		 484 aa  67  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 402 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 		 338 aa  66.6  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  21.35 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>