More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1970 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 346 aa  715    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  37.85 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  31.49 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  38.34 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 		 377 aa  122  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.51 
 
 		 479 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  28.52 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  35.83 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 381 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  33.85 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  36.51 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 		 398 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.07 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.91 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.17 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.78 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 423 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  26.98 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 353 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.35 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.08 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  30.26 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  29.17 
 
 		 359 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 377 aa  96.3  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 409 aa  95.9  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 418 aa  95.9  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  30.69 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  29.39 
 
 		 510 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  30.41 
 
 		 379 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  25.44 
 
 		 403 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 		 370 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  25.53 
 
 		 397 aa  92.8  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  30 
 
 		 387 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.16 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.31 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.79 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31.21 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 		 366 aa  90.5  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.52 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 406 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 446 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 406 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 420 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  30.35 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 397 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 396 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  30.85 
 
 		 561 aa  89.7  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.63 
 
 		 422 aa  89.7  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.78 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  27.12 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.56 
 
 		 387 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  24.56 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  30.25 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.56 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>