More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0783 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 469 aa  976    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 510 aa  249  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 464 aa  97.1  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.59 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  22.87 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  22.68 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  26.63 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  22.79 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  31.39 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  21.67 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  21.48 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  22.1 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  21.32 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  22.34 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  22.84 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  28.91 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.41 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.3 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  22.94 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  22.37 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  21.66 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.43 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  21.41 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  21.11 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  26.22 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.17 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  21.18 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  30.37 
 
 		 280 aa  57  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 465 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.17 
 
 		 337 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  20.77 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.17 
 
 		 337 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  21.11 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>