More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1357 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  92.71 
 
 		 429 aa  524  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  48 
 
 		 434 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  46.91 
 
 		 436 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  45.64 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  44.77 
 
 		 443 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  45.1 
 
 		 445 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  45.62 
 
 		 446 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  44.77 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  41.2 
 
 		 432 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 		 510 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  36.16 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 		 400 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 447 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 		 447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 449 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 454 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 454 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 486 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 442 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 442 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 455 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 462 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 454 aa  89.7  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 		 474 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 454 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  34.44 
 
 		 453 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 468 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 450 aa  86.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 449 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  34.73 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  30.33 
 
 		 470 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 461 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.9 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 489 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 489 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  29.08 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  25.62 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  27.45 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  28.42 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 476 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  31.54 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  30.87 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  23.89 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  28.48 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  29.47 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 800 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 484 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 486 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 450 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.13 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 499 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>