259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6513 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 418 aa  850    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  46.85 
 
 		 410 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  46.25 
 
 		 399 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  44.69 
 
 		 414 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 781 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  44.24 
 
 		 815 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0440  Radical SAM domain protein  42.82 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 		 794 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  36.86 
 
 		 414 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  33.42 
 
 		 723 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  26.63 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  26.63 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 385 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  26.47 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  26.47 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.63 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  27.02 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  21.68 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  22.06 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 444 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  23.42 
 
 		 280 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.37 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.37 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.08 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  29.1 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.08 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  23.56 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  24.79 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  24.79 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  21.46 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  29.41 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  29.41 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  30.91 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.71 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  20.73 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.42 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  32.28 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  31.75 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.1 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.1 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.1 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  31.41 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.36 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  36.81 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.32 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  21.83 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  31.35 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  31.94 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  31.94 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.87 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.2 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>