222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7955 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 794 aa  1601    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  45.61 
 
 		 815 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  42.58 
 
 		 781 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  48.28 
 
 		 399 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  46.68 
 
 		 410 aa  320  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  42.89 
 
 		 414 aa  296  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0440  Radical SAM domain protein  42.4 
 
 		 389 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 		 418 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  36.34 
 
 		 723 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  33.42 
 
 		 414 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5727  hypothetical protein  33.72 
 
 		 614 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1604  hypothetical protein  35.01 
 
 		 445 aa  169  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6917  hypothetical protein  33.84 
 
 		 441 aa  151  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6957  hypothetical protein  29.01 
 
 		 652 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  26.76 
 
 		 401 aa  119  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1515  hypothetical protein  31.48 
 
 		 795 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  26.7 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5109  hypothetical protein  33.07 
 
 		 583 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 431 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 408 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 381 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  24.77 
 
 		 408 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  21.56 
 
 		 369 aa  95.1  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  24.42 
 
 		 408 aa  94.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  24.64 
 
 		 438 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  20.46 
 
 		 391 aa  90.9  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 393 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 413 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 385 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.79 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.79 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 444 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  20.18 
 
 		 368 aa  83.2  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.54 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.54 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  21.33 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 411 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  24.44 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  24.58 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  24.3 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.13 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  29.07 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  21.1 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  24.3 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.38 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  28.49 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  25 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  24.3 
 
 		 411 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  25 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.1 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.84 
 
 		 394 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  20.56 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.55 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  24.09 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.55 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.1 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.1 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.81 
 
 		 395 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 397 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.81 
 
 		 396 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  20.28 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 		 410 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 		 410 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  21.71 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.74 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.81 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.81 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  21.53 
 
 		 402 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  21.53 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  25.34 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  21.57 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  24.08 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  20.53 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  30.41 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  33.11 
 
 		 456 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  20.33 
 
 		 397 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  20.33 
 
 		 397 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  17.65 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.34 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.34 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 290 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>