More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0440 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0440  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 389 aa  787    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  50.53 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  50.93 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  48.54 
 
 		 410 aa  356  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  44.88 
 
 		 781 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  43.21 
 
 		 815 aa  299  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  42.4 
 
 		 794 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  42.67 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  35.23 
 
 		 723 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.35 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  27 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  27 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  21.45 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.58 
 
 		 431 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.58 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.3 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.61 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.03 
 
 		 431 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.8 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.5 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.93 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.8 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.8 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  24.2 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.65 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.53 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.81 
 
 		 370 aa  87  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.65 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.65 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.67 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.67 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.36 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  25.27 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  23.7 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  30.1 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  27.78 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  29.55 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  22.45 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  21.25 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  24.36 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  21.89 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  21.89 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  24.36 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  24.29 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  23.94 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  24.16 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  24.16 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  30.06 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  24.65 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  23.31 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  23.16 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  23.4 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  24.16 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.66 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.06 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  20.54 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.06 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>