More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2646 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  100 
 
 		 723 aa  1485    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 815 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 781 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  36.34 
 
 		 794 aa  240  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 		 418 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  34.07 
 
 		 410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  35.36 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0440  Radical SAM domain protein  35.23 
 
 		 389 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  32.81 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 413 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 368 aa  111  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.96 
 
 		 383 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.19 
 
 		 370 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 402 aa  101  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 370 aa  97.8  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.49 
 
 		 438 aa  97.8  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 431 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 		 397 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 		 397 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 385 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 431 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 428 aa  91.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 385 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.47 
 
 		 395 aa  90.5  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  22.17 
 
 		 385 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  22.17 
 
 		 385 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 444 aa  90.5  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.28 
 
 		 396 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  22.17 
 
 		 385 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  22.17 
 
 		 385 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  22.17 
 
 		 385 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.21 
 
 		 395 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  25.27 
 
 		 280 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 435 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 385 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 407 aa  89  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.02 
 
 		 396 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 435 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 435 aa  89  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  20.94 
 
 		 369 aa  88.2  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 407 aa  88.2  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  30.19 
 
 		 433 aa  87.8  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.2 
 
 		 398 aa  87.4  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.52 
 
 		 414 aa  87.4  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.2 
 
 		 398 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.91 
 
 		 398 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  25.47 
 
 		 370 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.2 
 
 		 398 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.2 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  25 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  26.94 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.94 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  29.1 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  26.94 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  26.94 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  24.74 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 408 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  25.65 
 
 		 408 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  25.43 
 
 		 408 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.27 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.17 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.43 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.43 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  21.95 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.94 
 
 		 431 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 397 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  27.44 
 
 		 460 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  24.74 
 
 		 411 aa  80.5  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  25.52 
 
 		 411 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  21.68 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  21.68 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  22.52 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 401 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 800 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  24.31 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.12 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  23.68 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 383 aa  70.5  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 		 393 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  21.94 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  20.95 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>