More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3007 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  100 
 
 
431 aa  890    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 
413 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 
414 aa  136  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 
781 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  27.53 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 
410 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 
418 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0440  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 
389 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  25.07 
 
 
401 aa  106  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  28.03 
 
 
370 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 
397 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 
370 aa  103  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  25.43 
 
 
399 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.84 
 
 
414 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 
815 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
794 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.56 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 
402 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  23.43 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 
401 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  24.29 
 
 
723 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  28.78 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  33.56 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  32.43 
 
 
431 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  33.11 
 
 
431 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.9 
 
 
398 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  33.11 
 
 
447 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  33.11 
 
 
431 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  33.11 
 
 
431 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 
397 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.9 
 
 
398 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.45 
 
 
398 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.45 
 
 
398 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 
414 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  29.56 
 
 
440 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.63 
 
 
398 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  32.24 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 
435 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  35.81 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  31.08 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  29.93 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  29.93 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  31.97 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  29.93 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  31.97 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  31.58 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  25.78 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.79 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  30.41 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.79 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.25 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.79 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.25 
 
 
395 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.25 
 
 
395 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.79 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  30.41 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  30.41 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  30.41 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  30.2 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  30.56 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.97 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  29.73 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  35.05 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 
518 aa  73.9  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>