More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1837 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 518 aa  1060    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  30.75 
 
 		 468 aa  186  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  29.62 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 464 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 481 aa  150  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.06 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 457 aa  126  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25 
 
 		 484 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 462 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 476 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 439 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 476 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 458 aa  107  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  40.4 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 456 aa  103  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.97 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  21.45 
 
 		 473 aa  100  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.74 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 452 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 351 aa  89.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 728 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  34 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  31.97 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  28.12 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  29.53 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 339 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  31.08 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.88 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  31.08 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  31.08 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.37 
 
 		 447 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.37 
 
 		 431 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.37 
 
 		 431 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.37 
 
 		 431 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  30.46 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  30.46 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  30.41 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  30.41 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.67 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 486 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 344 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  30.41 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  29.05 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 368 aa  67  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 411 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  28.05 
 
 		 385 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  28.05 
 
 		 385 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>