192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1508 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 463 aa  939    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 463 aa  939    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 		 467 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.23 
 
 		 450 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.14 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  21.44 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.94 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 460 aa  98.2  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  21.41 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  21.54 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  20.45 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  22.31 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  21.25 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  21.12 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  21.41 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  23.42 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 800 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 728 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  21.3 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  21.49 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.32 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  21.29 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  21.57 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.11 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  22.57 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  22.25 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  22.94 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  21.98 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  22.13 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 454 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  21.5 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  21.56 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  21.95 
 
 		 357 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 370 aa  54.3  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  20.25 
 
 		 418 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1924  radical SAM superfamily protein  24.75 
 
 		 331 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1807  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  22.13 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.37 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  22.74 
 
 		 342 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  22.16 
 
 		 356 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  23.1 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  20.6 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 339 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>