More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3060 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  702    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  36.98 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 		 434 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 449 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 455 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 442 aa  116  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 442 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 449 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  26.93 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.3 
 
 		 483 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 468 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 454 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 477 aa  93.6  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 454 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 419 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 394 aa  89.4  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  23.75 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 446 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 445 aa  86.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  31.02 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  24.65 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 518 aa  72.8  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  28.41 
 
 		 477 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.37 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  33.11 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.67 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  32.1 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 507 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.84 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.37 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 461 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  26.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  26.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  22.79 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  30.63 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  23.67 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.68 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>