More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1690 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  100 
 
 		 330 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  37.85 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  33.67 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 380 aa  135  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  37.22 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 377 aa  125  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 380 aa  125  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.5 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 501 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.8 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.52 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  36.46 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  35.52 
 
 		 398 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  28.27 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.15 
 
 		 394 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 496 aa  112  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.18 
 
 		 479 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.72 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  35.2 
 
 		 399 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.37 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.78 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  35.19 
 
 		 405 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  33.17 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  35.12 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 491 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 491 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  26.74 
 
 		 491 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 491 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 491 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 491 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  33.67 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 491 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.84 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  25.96 
 
 		 491 aa  99.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  28.64 
 
 		 413 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 		 394 aa  99.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 382 aa  99.4  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.17 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  26.53 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 368 aa  96.3  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  30.22 
 
 		 510 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 414 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 405 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.12 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  24.82 
 
 		 393 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.52 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  26.06 
 
 		 487 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.57 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 482 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.27 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  28.38 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 418 aa  92.8  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 404 aa  92.8  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 347 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.78 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>