More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1353 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 429 aa  875    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  92.71 
 
 		 298 aa  524  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  49.07 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  48.83 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  44.98 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  44.39 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  46.01 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  45.2 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  45.75 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  43.56 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  42.39 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  44.77 
 
 		 281 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 		 394 aa  176  9e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 454 aa  132  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 454 aa  132  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 474 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 461 aa  99.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 434 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  23.52 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.33 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  27.33 
 
 		 470 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 452 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 489 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 462 aa  90.5  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 452 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 458 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  22.32 
 
 		 448 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 456 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 489 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  23.53 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.27 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25.93 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  22.28 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  32.91 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  25.96 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  26.49 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  26.49 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  21.96 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 728 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 800 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  21.43 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>