More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0679 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 462 aa  963    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  40.31 
 
 		 465 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 492 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  30.15 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 489 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 452 aa  197  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  34.15 
 
 		 484 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  33.42 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 489 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  32.32 
 
 		 485 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  32.69 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 476 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  29.71 
 
 		 473 aa  170  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 403 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 351 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 518 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 499 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 728 aa  93.2  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  31.58 
 
 		 432 aa  93.2  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 		 290 aa  92.8  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 481 aa  91.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 800 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 459 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 298 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 507 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  25.37 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  26.65 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  26.65 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  32.87 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.31 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.15 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.15 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  23.16 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  26.24 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.46 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.01 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>