172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0042 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  100 
 
 		 452 aa  948    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  47.1 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 486 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 447 aa  146  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 454 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 454 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 		 449 aa  122  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  25.29 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 434 aa  113  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25.68 
 
 		 432 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  28.13 
 
 		 394 aa  99.8  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 468 aa  93.2  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 477 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.67 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 454 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  24.55 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.59 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  21.1 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  20.85 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  23.8 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  21.41 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  22.07 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  23.54 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.13 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  22.47 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.68 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  22.47 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 794 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  21.11 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.11 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.11 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  21.09 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  29.93 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  21.87 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  21.09 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.96 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  21.09 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  21.87 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.44 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.52 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  22.53 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  21.67 
 
 		 499 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 464 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.81 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  19.81 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  20.83 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>