More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2395 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 394 aa  799    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  64.5 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  30.71 
 
 		 446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 434 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 429 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  30.17 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 454 aa  149  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 454 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 442 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 442 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 455 aa  143  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 486 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 447 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 449 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.14 
 
 		 483 aa  133  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 477 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  36.16 
 
 		 298 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 474 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  26.6 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 442 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.79 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 489 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  28.13 
 
 		 452 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 447 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  27.33 
 
 		 470 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 489 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 728 aa  93.6  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  24.07 
 
 		 484 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 476 aa  89.7  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  23.84 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 462 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 460 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 453 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 454 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.54 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 492 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 476 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.27 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.31 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  30 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 800 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>