More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0575 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 434 aa  894    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  55.76 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  54.8 
 
 		 436 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  49.07 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  46.81 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  44.63 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  46.81 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  46.27 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  48.22 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  43.43 
 
 		 432 aa  362  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  45.07 
 
 		 510 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  48 
 
 		 298 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  41.2 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.92 
 
 		 447 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 474 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 442 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 442 aa  133  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.67 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.02 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 489 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 457 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 485 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.38 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.73 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 468 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 449 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 486 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 476 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 484 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  24.07 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 728 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25.2 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.21 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  25.19 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 800 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.81 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>