More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2384 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 339 aa  693    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 455 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  33.44 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  27.24 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 442 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 442 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 447 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 486 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  31.58 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 468 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 449 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 444 aa  95.9  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 394 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  25.8 
 
 		 452 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 443 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 434 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  29.15 
 
 		 454 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 400 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 419 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  23.55 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  32.19 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 474 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.23 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  34.03 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.23 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 510 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 463 aa  72.8  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 460 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 		 464 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.79 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  24.87 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 447 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 474 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  23.14 
 
 		 462 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  21.41 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 453 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.54 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.12 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 496 aa  59.7  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  25.2 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  22.4 
 
 		 473 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  30.77 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  30.77 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  25.6 
 
 		 723 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>