More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1293 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
446 aa  928    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  55.06 
 
 
461 aa  531  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  51.71 
 
 
465 aa  502  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  47.95 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  51.25 
 
 
462 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  47.47 
 
 
466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  50.23 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  48.75 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  46.49 
 
 
471 aa  437  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  49.33 
 
 
479 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  45.29 
 
 
446 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  44.37 
 
 
477 aa  403  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  44.37 
 
 
486 aa  401  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  45.17 
 
 
460 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  44.87 
 
 
422 aa  333  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  44.87 
 
 
422 aa  333  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 
458 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  37.47 
 
 
460 aa  328  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 
465 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  36.41 
 
 
460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  38.22 
 
 
462 aa  313  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 
482 aa  272  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 
482 aa  272  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 
481 aa  266  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 
482 aa  256  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 
482 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  34.65 
 
 
362 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  32.48 
 
 
368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  32.95 
 
 
387 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 
371 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  33.12 
 
 
357 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 
410 aa  149  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 
501 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.95 
 
 
479 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 
319 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.33 
 
 
346 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 
325 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 
496 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.47 
 
 
379 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  32.97 
 
 
510 aa  93.2  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 
330 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  38.22 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 
377 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.9 
 
 
366 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 
330 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 
363 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
358 aa  87  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 
333 aa  86.3  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  27.64 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 
358 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 
359 aa  84  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 
409 aa  84  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.24 
 
 
391 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.4 
 
 
349 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.24 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.9 
 
 
769 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.87 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  29.87 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 
410 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 
327 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  25.94 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.39 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  23.15 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  24.93 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  32.54 
 
 
379 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.43 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  28.17 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>