More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1646 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  100 
 
 		 368 aa  759    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  57.51 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  44.54 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  40.69 
 
 		 362 aa  259  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  40.49 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 		 462 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  38.19 
 
 		 466 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 446 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  34.53 
 
 		 422 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  34.53 
 
 		 422 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  34.26 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  30.62 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  33.68 
 
 		 471 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  31.45 
 
 		 477 aa  182  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  33 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  33.76 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  33.65 
 
 		 460 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  34.08 
 
 		 479 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  31.12 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 482 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 481 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.59 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.71 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.85 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.48 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.56 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.05 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.05 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.01 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.99 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.99 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 1005 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  31 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  26.38 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  28.01 
 
 		 769 aa  73.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.52 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  30.16 
 
 		 1014 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  30.52 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  23.76 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.03 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  23.49 
 
 		 510 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2955  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  23.3 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>