More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0350 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  739    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  52.07 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  52.51 
 
 		 393 aa  401  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.62 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  41.69 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  44.31 
 
 		 377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  38.42 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 363 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  37.35 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  28.61 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.05 
 
 		 561 aa  136  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.77 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.6 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  31.63 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.81 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 496 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.95 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.84 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.41 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  25.28 
 
 		 769 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  29.17 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25.08 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.07 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.02 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  23.96 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.35 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 389 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.97 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.17 
 
 		 390 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.28 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.43 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.28 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  24.85 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  30.22 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 480 aa  95.9  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.96 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.8 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.01 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 380 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  29.27 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 368 aa  92.8  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.49 
 
 		 373 aa  92.8  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.35 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.61 
 
 		 382 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.26 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.62 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>