More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1725 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  956    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  62.61 
 
 		 479 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  59.69 
 
 		 466 aa  586  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  54.36 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  51.01 
 
 		 450 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  49.43 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  46.7 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  48.34 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  43.51 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  41.2 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  41.24 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  41.15 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  41.06 
 
 		 462 aa  346  6e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  37.73 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  37.38 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  38.94 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 		 486 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  35.99 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 482 aa  292  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  42.35 
 
 		 422 aa  282  9e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  42.35 
 
 		 422 aa  282  9e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  30.25 
 
 		 357 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 362 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  34.53 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  31.49 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.54 
 
 		 479 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 333 aa  99.8  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  30.04 
 
 		 510 aa  99.8  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 330 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 330 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 418 aa  93.2  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 496 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 501 aa  90.5  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.62 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 332 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.94 
 
 		 349 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  26.46 
 
 		 373 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  27.04 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23.79 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  26.37 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.61 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 358 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.19 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.81 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.56 
 
 		 366 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  23.25 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.32 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  24.54 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  27.79 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.15 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.44 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  25 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  31.68 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.04 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>