More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16100 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  100 
 
 
462 aa  954    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  72.38 
 
 
450 aa  713    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  61.61 
 
 
466 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  53.39 
 
 
479 aa  558  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  54.88 
 
 
460 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  52.02 
 
 
452 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  48.8 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  51.25 
 
 
446 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  48.98 
 
 
465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  42.14 
 
 
460 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  43.74 
 
 
451 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  45.23 
 
 
462 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  42.44 
 
 
458 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  40.59 
 
 
486 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 
465 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 
482 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  43.22 
 
 
482 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  41.22 
 
 
471 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  40.69 
 
 
477 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  39.96 
 
 
446 aa  359  5e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  39.32 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 
482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  44.87 
 
 
482 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 
481 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  39.82 
 
 
422 aa  279  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  39.82 
 
 
422 aa  279  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  33.96 
 
 
368 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  36.3 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  36.65 
 
 
362 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 
410 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  32.04 
 
 
357 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  35.97 
 
 
387 aa  170  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 
325 aa  113  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 
501 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 
333 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 
330 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
377 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 
380 aa  103  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.83 
 
 
479 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  28.9 
 
 
510 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 
380 aa  100  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 
319 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 
418 aa  97.8  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
336 aa  97.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 
358 aa  97.1  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 
349 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.42 
 
 
349 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 
363 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.58 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 
496 aa  94  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 
330 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.79 
 
 
335 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.58 
 
 
561 aa  92.8  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 
330 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  26.01 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 
333 aa  90.9  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.33 
 
 
346 aa  90.1  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  26.28 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 
323 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.89 
 
 
391 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  35.86 
 
 
418 aa  87.4  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 
427 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.46 
 
 
397 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.15 
 
 
401 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 
401 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 
401 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
334 aa  86.7  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 
428 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.74 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  27.04 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  27.68 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.26 
 
 
367 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 
358 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  26.33 
 
 
366 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>