More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1425 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 403 aa  838    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  55.13 
 
 		 412 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  52.08 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  36.1 
 
 		 397 aa  272  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  36.13 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  37.87 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  37.09 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.13 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.18 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 333 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.35 
 
 		 561 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.78 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.93 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.15 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 330 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.55 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  31.12 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 354 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.75 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 317 aa  106  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  28.66 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.72 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  26.92 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 491 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25.31 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.83 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 491 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  25.32 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 332 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 316 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 480 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  27.43 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 333 aa  97.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 460 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.75 
 
 		 769 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  29.67 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 347 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  24 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  25 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.77 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 501 aa  90.1  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 333 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.89 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.93 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>