More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1545 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 466 aa  971    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  67.25 
 
 		 479 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  61.61 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  60.27 
 
 		 460 aa  578  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  58.2 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  55.53 
 
 		 452 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  49.13 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  47.98 
 
 		 465 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  47.47 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  45.13 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  45.82 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  41.78 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  40.18 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  39.36 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  39.82 
 
 		 446 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 		 482 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  40.63 
 
 		 482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 481 aa  353  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  38.51 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  40.5 
 
 		 477 aa  335  7.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  45.7 
 
 		 422 aa  320  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  45.7 
 
 		 422 aa  320  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  38.19 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  36.65 
 
 		 387 aa  194  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  36.8 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  36.3 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  30.93 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.17 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 325 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 330 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  31.23 
 
 		 510 aa  97.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 333 aa  97.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 378 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 501 aa  95.5  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.42 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 319 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 359 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 380 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.6 
 
 		 330 aa  89.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 336 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 327 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  27.21 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  27.47 
 
 		 381 aa  87.4  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.44 
 
 		 373 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.96 
 
 		 335 aa  86.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  26.86 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 363 aa  86.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.16 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.9 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.6 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  22.87 
 
 		 561 aa  83.2  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  28.07 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.21 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  26.21 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.47 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.91 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  22.31 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.32 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  22.07 
 
 		 356 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  24.91 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25.82 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>