More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2884 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  100 
 
 
370 aa  764    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 
363 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 
405 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 
404 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 
377 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 
389 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  25.41 
 
 
397 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  26.28 
 
 
403 aa  99.4  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  29.29 
 
 
393 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.4 
 
 
335 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 
359 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.25 
 
 
479 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  23.45 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 
327 aa  89.7  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.83 
 
 
356 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 
330 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.32 
 
 
332 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
380 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.85 
 
 
397 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.98 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.24 
 
 
366 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 
357 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.55 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.64 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  24.24 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  23.79 
 
 
561 aa  82.8  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.75 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.78 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.3 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.09 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.52 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  24.47 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.7 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.06 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.49 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.19 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  23.67 
 
 
510 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 
460 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  25.65 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.69 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.29 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.69 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.69 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  21.1 
 
 
501 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  25.83 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.69 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.35 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  21.5 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.88 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.88 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.22 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.06 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  22.69 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  22.69 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.94 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>