More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0393 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  100 
 
 		 393 aa  811    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  69.64 
 
 		 397 aa  594  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  52.51 
 
 		 359 aa  401  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  41.29 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  39.36 
 
 		 379 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  41.8 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  36.13 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  35.9 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  39.24 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  28.78 
 
 		 430 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  35.4 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 330 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.97 
 
 		 479 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.98 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 496 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.79 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.04 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 380 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.66 
 
 		 561 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 333 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.84 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.76 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 429 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  29.03 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 317 aa  97.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  28.22 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.5 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  24.82 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.63 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 393 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.6 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.9 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  23.57 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.24 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.16 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 480 aa  89.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.53 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  27.99 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.37 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  25.52 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 325 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.56 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 491 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.82 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 370 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  22.87 
 
 		 769 aa  86.7  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 323 aa  86.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  28.57 
 
 		 370 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.17 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.33 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.26 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>