More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1154 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 377 aa  778    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  47.4 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  45.08 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  44.31 
 
 		 359 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  41.8 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  37.53 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  33.7 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 327 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  27.16 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 496 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  30.71 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.71 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.23 
 
 		 479 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 418 aa  109  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.52 
 
 		 561 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.01 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 342 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  28.32 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  27.96 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 466 aa  96.7  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 422 aa  96.3  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.42 
 
 		 769 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.5 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.55 
 
 		 407 aa  92.8  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.57 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 399 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 501 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 332 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.32 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 491 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.73 
 
 		 380 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.73 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.95 
 
 		 326 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.52 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 480 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  23.87 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.03 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  23.94 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.16 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  23.81 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.15 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.78 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>