More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0573 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  743    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  52.08 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  48.83 
 
 		 412 aa  349  3e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  38.55 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  39.24 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  36.34 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  34.12 
 
 		 381 aa  230  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  29.57 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.1 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.69 
 
 		 479 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.74 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 496 aa  115  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.76 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.84 
 
 		 561 aa  110  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 358 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.26 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.72 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  27.44 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31.67 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.67 
 
 		 335 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.48 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  27.44 
 
 		 491 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 491 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  27.13 
 
 		 491 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 394 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 491 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 491 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 491 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 491 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.6 
 
 		 380 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  21.31 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 439 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.11 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.82 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.1 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 423 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.51 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.58 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  22.58 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 480 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 501 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  32.78 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 393 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.49 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 418 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  21.29 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 418 aa  92.8  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.85 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  27.74 
 
 		 769 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.22 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.19 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  27.32 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 429 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>