More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1373 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  100 
 
 		 412 aa  850    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  55.13 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  48.83 
 
 		 363 aa  349  4e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  35.9 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  33.51 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  34.27 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  34.84 
 
 		 379 aa  206  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  32.71 
 
 		 377 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.9 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 399 aa  96.7  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.45 
 
 		 479 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 375 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 496 aa  86.7  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.88 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  22.18 
 
 		 561 aa  83.2  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  25.94 
 
 		 769 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  23.25 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  33.13 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  28.52 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  31.37 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  24.54 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.28 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  22.06 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  23.88 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  23.57 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  20.63 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  23.77 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25.82 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  20.98 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  23.49 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  30.77 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.72 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.48 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  20.63 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  23.72 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  24.63 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  22.97 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.24 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.54 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  24.07 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>