More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1236 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 
397 aa  827    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  69.64 
 
 
393 aa  594  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  52.07 
 
 
359 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  40.32 
 
 
381 aa  329  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  39.73 
 
 
379 aa  327  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  36.1 
 
 
403 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  37.53 
 
 
377 aa  263  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 
363 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  33.51 
 
 
412 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 
404 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  28.49 
 
 
430 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  29.41 
 
 
479 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  33.09 
 
 
327 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  31.14 
 
 
335 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 
330 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
405 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 
501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 
381 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 
333 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 
380 aa  119  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 
414 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 
496 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.64 
 
 
349 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
363 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  28.27 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.36 
 
 
561 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.9 
 
 
346 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 
380 aa  113  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 
418 aa  112  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 
334 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.24 
 
 
397 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 
384 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 
377 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 
356 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 
377 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.78 
 
 
373 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
317 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 
378 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 
330 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 
429 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 
332 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.92 
 
 
380 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 
325 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  28.62 
 
 
370 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 
370 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 
342 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.56 
 
 
378 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  26.56 
 
 
377 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  26.56 
 
 
377 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  26.81 
 
 
342 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.78 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  28.72 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
480 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 
407 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  26.25 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.61 
 
 
378 aa  96.3  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.12 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  23.64 
 
 
769 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.13 
 
 
366 aa  94.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 
347 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.96 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.96 
 
 
386 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 
491 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.96 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.94 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.58 
 
 
376 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25.17 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.62 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 
491 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  26.23 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 
491 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  28.42 
 
 
491 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  27.93 
 
 
355 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 
491 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 
364 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 
323 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 
491 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 
491 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.04 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.25 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 
491 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.68 
 
 
373 aa  89.7  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.83 
 
 
379 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 
409 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>