More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0794 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  926    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.5 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.04 
 
 		 346 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.11 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  29.43 
 
 		 368 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.36 
 
 		 397 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 414 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.64 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 364 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.79 
 
 		 769 aa  110  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.05 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 358 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 356 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.15 
 
 		 356 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 		 367 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 334 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  28.16 
 
 		 381 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 501 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 407 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  24.48 
 
 		 491 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  28.38 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.44 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.01 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 323 aa  99.8  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.89 
 
 		 378 aa  99.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.14 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  23.57 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  27.3 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 347 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.84 
 
 		 414 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.94 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.18 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.66 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.9 
 
 		 332 aa  94  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 372 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.66 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  23.83 
 
 		 326 aa  94  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 393 aa  93.6  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 376 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.67 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 399 aa  93.2  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  24.44 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>