More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04410 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  72.38 
 
 
462 aa  713    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  100 
 
 
450 aa  934    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  58.2 
 
 
466 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  55.53 
 
 
479 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  51.92 
 
 
452 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 
460 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  47.97 
 
 
461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  47.88 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  48.75 
 
 
446 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  41.46 
 
 
460 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  42.44 
 
 
462 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 
451 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 
458 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  41.72 
 
 
446 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  41.49 
 
 
486 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  40.62 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  42.67 
 
 
482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  42.67 
 
 
482 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
460 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  42.39 
 
 
471 aa  346  5e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 
482 aa  342  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  37.88 
 
 
482 aa  334  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 
481 aa  320  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  39.05 
 
 
422 aa  276  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  39.05 
 
 
422 aa  276  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 
410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  32.79 
 
 
368 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  31.48 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  35 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  35.27 
 
 
387 aa  176  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  33.46 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
325 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 
333 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 
501 aa  107  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 
330 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
380 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 
377 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.72 
 
 
335 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 
349 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 
330 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  29.24 
 
 
510 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 
380 aa  99  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 
418 aa  96.7  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.38 
 
 
479 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
363 aa  96.3  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 
418 aa  96.3  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  22.77 
 
 
561 aa  94.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.57 
 
 
349 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 
333 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 
319 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.42 
 
 
346 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.48 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  25.08 
 
 
769 aa  91.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.52 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
334 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 
410 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
358 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.99 
 
 
387 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.46 
 
 
387 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  24.51 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 
358 aa  86.7  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25 
 
 
359 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  36.14 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  25.93 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 
394 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.3 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 
332 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  27.7 
 
 
393 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.1 
 
 
422 aa  84  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  26.3 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.59 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
336 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.23 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25.72 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>