More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0970 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  100 
 
 
452 aa  937    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  55.53 
 
 
466 aa  542  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  52.69 
 
 
479 aa  514  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  52.02 
 
 
462 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  51.92 
 
 
450 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  49.43 
 
 
460 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  49.33 
 
 
465 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  48.98 
 
 
461 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  50.23 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  45.66 
 
 
451 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  43.81 
 
 
462 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  42.73 
 
 
446 aa  364  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  41.67 
 
 
471 aa  359  6e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  42.63 
 
 
458 aa  358  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  41.94 
 
 
460 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  41.59 
 
 
477 aa  350  3e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  41.31 
 
 
486 aa  347  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  41.59 
 
 
465 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  39.95 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  41.19 
 
 
482 aa  319  7.999999999999999e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 
482 aa  312  9e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  36.66 
 
 
481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  35.73 
 
 
482 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  42.29 
 
 
422 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  42.29 
 
 
422 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 
410 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  33.77 
 
 
368 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  28.2 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 
362 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 
371 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  35.14 
 
 
387 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.53 
 
 
479 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 
330 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
330 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 
496 aa  97.8  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 
333 aa  93.2  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 
377 aa  90.5  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
349 aa  90.1  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 
327 aa  89.7  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 
347 aa  89.7  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 
325 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
501 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
418 aa  87.4  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.5 
 
 
335 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.89 
 
 
371 aa  87  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 
380 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  25.56 
 
 
403 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.69 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  24.91 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.83 
 
 
365 aa  84  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  29.09 
 
 
326 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 
399 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 
363 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.66 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.15 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.49 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.99 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  23.8 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  24.75 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.91 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  25.83 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.23 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 
480 aa  76.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  24.57 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  26.44 
 
 
363 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.08 
 
 
346 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5768  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.92 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  0.949586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  34.32 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.37 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  26.23 
 
 
510 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5988  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.25 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.71 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.94 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 
565 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  24.12 
 
 
769 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>