More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0177 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  985    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  54.4 
 
 
446 aa  522  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  54.2 
 
 
486 aa  504  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  51.26 
 
 
477 aa  484  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  49.66 
 
 
451 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  48.97 
 
 
465 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  43.68 
 
 
461 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  46.49 
 
 
446 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  41.22 
 
 
462 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  40.18 
 
 
466 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  40.73 
 
 
479 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 
452 aa  358  9e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 
460 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  49.11 
 
 
422 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  49.11 
 
 
422 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  42.29 
 
 
450 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  39.37 
 
 
460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  43.8 
 
 
458 aa  326  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  39.03 
 
 
465 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  35.78 
 
 
460 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  39.31 
 
 
481 aa  285  9e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  34.87 
 
 
482 aa  279  7e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 
482 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  35.88 
 
 
482 aa  273  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  35.62 
 
 
482 aa  272  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  32.42 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  32.56 
 
 
357 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  33.68 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 
362 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 
371 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 
410 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 
501 aa  94.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 
325 aa  90.5  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.55 
 
 
496 aa  90.5  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 
418 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 
349 aa  86.7  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.5 
 
 
479 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.22 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 
330 aa  84  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
333 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.48 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  27.65 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  26.95 
 
 
330 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.56 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  27.52 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 
333 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.4 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  24.61 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 
358 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.16 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  24 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  25.42 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  22.6 
 
 
365 aa  69.7  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  24.61 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  22.77 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.74 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.87 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.62 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  26.62 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.34 
 
 
367 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  24.21 
 
 
370 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  23.18 
 
 
319 aa  67  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 
358 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  24.29 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  24.29 
 
 
377 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.48 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.35 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
384 aa  66.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  24.55 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.08 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>