More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0555 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  100 
 
 
451 aa  946    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  50.57 
 
 
465 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  48.65 
 
 
446 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  49.66 
 
 
471 aa  477  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  47.95 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  47.6 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  48.51 
 
 
477 aa  444  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  46.28 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  45.66 
 
 
452 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  45.13 
 
 
466 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  43.74 
 
 
462 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 
450 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  42.3 
 
 
460 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  39.64 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  39.2 
 
 
462 aa  329  6e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  42.23 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  42.23 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
465 aa  320  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 
458 aa  319  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  38.9 
 
 
460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  36.55 
 
 
460 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 
481 aa  286  5e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 
482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 
482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 
482 aa  276  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 
482 aa  272  9e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  32.67 
 
 
368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  35.19 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 
371 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  33.1 
 
 
362 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  34.66 
 
 
387 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.9 
 
 
479 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 
330 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.11 
 
 
335 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 
333 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.62 
 
 
330 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 
347 aa  83.2  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 
501 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 
384 aa  79.7  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
327 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.03 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.55 
 
 
394 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  26.76 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.83 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  24.28 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.29 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  25.09 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.85 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  28.57 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 
319 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 
394 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.43 
 
 
332 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  25.99 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.77 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  25.24 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  24.92 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  25.44 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  25.24 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  25.77 
 
 
510 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.63 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0516  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.92 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  24.7 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 
394 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 
407 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  23.9 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>