More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0183 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  999    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  70.44 
 
 		 482 aa  743    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  70.65 
 
 		 482 aa  744    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  65.2 
 
 		 482 aa  694    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  65.2 
 
 		 482 aa  703    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  42.38 
 
 		 462 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  40.41 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  39.47 
 
 		 450 aa  320  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  36.66 
 
 		 452 aa  309  6.999999999999999e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  36.12 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  35.81 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  39.68 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  36.4 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  39.8 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  39.35 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  33.78 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  38.54 
 
 		 486 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 		 451 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  39.31 
 
 		 471 aa  286  7e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  36.61 
 
 		 422 aa  246  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  36.61 
 
 		 422 aa  246  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  31.1 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 362 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  31.8 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 410 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  30.91 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  27.86 
 
 		 381 aa  97.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.74 
 
 		 379 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.76 
 
 		 479 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 380 aa  90.9  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 496 aa  90.1  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 347 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 480 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.87 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.37 
 
 		 346 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.55 
 
 		 349 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 358 aa  87.4  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 501 aa  87.4  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.78 
 
 		 390 aa  87.4  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 363 aa  86.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.08 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 359 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.14 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  32.68 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  31.4 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  23.69 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.79 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  25.09 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  25.34 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 1005 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.14 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  31.94 
 
 		 379 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  27.19 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2955  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.28 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.28 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>